13 лет работала в Центре детской онкологии, гематологии и иммунологии в Боровлянах, еще 3 года в РНПЦ детской хирургии. Одновременно вела прием в «Лоде», Центре лазерной дерматологии «HappyDerm».
В 2022 году Елена Шарафанович, которая была директором частной «Клиники А1», попала в центр скандала. Один из соучредителей медцентра писал жалобы на свою же клинику, потому что "воевал" с другим соучредителем, Русланом Шарафановичем — это муж Елены. В результате у «А1» забрали лицензию, и работа была парализована. А на саму Елену одна из сотрудниц написала донос за «распространение экстремистских материалов». Её судили, она получила штраф. Клиника вскоре закрылась.
В конце января 2025 года состоится суд над Еленой за участие в акциях протеста 2020 года. Месяцем ранее за это же был осужден ее муж Руслан. Приговор неизвестен.

