Okołotowicz został aresztowany na cmentarzu. KGB zwabiło tam księdza podstępem: wezwali go i powiedzieli, że zmarła kobieta i potrzebuje katolickiego pochówku. Na cmentarzu skuli go kajdankami i założyli mu na głowę czarny hełm, żeby nikt nie widział, kogo i dokąd zabierają.
Dwoje jego parafian, mężczyzna i kobieta, zostali zatrzymani jednocześnie. Spędzili około dziewięciu miesięcy w areszcie śledczym KGB, gdzie zostali zmuszeni do złożenia zeznań na temat rzekomych spotkań księdza z zagranicznymi dyplomatami.
Oskarżenia ostatecznie postawione Okołotowiczowi były absurdalne: rzekomo w jakiś sposób skierował rosyjskie i białoruskie samoloty sił powietrznych w przeciwnym kierunku, powodując w ten sposób szkody nie tylko na Białorusi, ale także w rosyjskich Siłach Powietrzno-Kosmicznych – łącznie milion euro. Po jego aresztowaniu skonfiskowano mu około 270 000 euro – głównie z funduszy parafialnych, a nie z prywatnych środków księdza. Kwota ta została przeznaczona na spłatę długu, a pozostała część została zaksięgowana jako dopłata w rublach białoruskich.
W tym czasie Okołotowicz był już od dłuższego czasu pod obserwacją, ale nie udało się znaleźć niczego, co mogłoby dowodzić szpiegostwa.
Ksiądz stał się kolejną postacią religijną dotkniętą represjami reżimu wobec wspólnot religijnych na Białorusi.
Genrikh doznał zawału serca i niedawno przeszedł operację żołądka z powodu raka. Wymaga nadzoru medycznego i stałego przyjmowania leków. Przez ponad rok spał na podłodze i deskach; przeniesiono go na łóżko piętrowe dopiero przed rozprawą.
KGB postawiło Okołotowyczowi specjalny warunek zwolnienia. Po powrocie do Wołożyna miał zaprosić nuncjusza apostolskiego Watykanu na nabożeństwo i dyskretnie wręczyć mu pendrive z obciążającymi dowodami – pretekst do zdyskredytowania dyplomaty. W tym czasie nuncjuszem na Białorusi był Ante Jozic . Ta prowokacja wobec nuncjusza nie była jedyną: według Kryłowa, KGB proponowało podobne scenariusze innym zagranicznym dyplomatom, głównie polskim. Ksiądz odmówił wszystkiego: „Jestem całkowicie przesiąknięty Bożymi celami kościelnymi. A to, czego ode mnie żądacie, jest zbrodnią. Nie mogę zdradzić Boga”.
W listopadzie 2025 r. został ułaskawiony po wizycie na Białorusi przez prefekta Dykasterii Kościołów Wschodnich, kardynała Claudio Gugerottiego, jako specjalnego wysłannika papieża Leona XIV.
